使用差示掃描量熱儀 (DSC) 研究基于DNA的相互作用和基于核酸的療
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1950 年代,James Watson、Francis Crick、Rosalind Franklin 和 Maurice Wilkins 的研究成果導(dǎo)致了脫氧核糖核酸 (DNA) 雙螺旋構(gòu)象的發(fā)現(xiàn) 。以 DNA 為核心,許多基于核酸的檢測(cè)被用于制藥、生物化學(xué)、生物技術(shù)、分子生物學(xué)、基于目標(biāo)的藥物設(shè)計(jì)和其他基于 DNA 的技術(shù) 。此外,DNA 是眾多抗腫瘤藥物、抗病毒藥物和多種抗菌藥物的分子靶點(diǎn) 。從歷史上看,有幾種方法可以開(kāi)發(fā)一些干擾 DNA 合成的藥理和治療藥物 。由于許多 DNA 結(jié)合相互作用的治療效果與所得復(fù)合物的熱力學(xué)特征相關(guān),
差示掃描量熱儀 (DSC) 可為核酸、修飾的核酸和核酸-配體相互作用提供獨(dú)特的互補(bǔ)信息,是獲取熱力學(xué)參數(shù)的有力方法。DSC差示掃描量熱儀是一種直接的、獨(dú)立于模型的測(cè)量工具,可補(bǔ)充通過(guò)各種物理化學(xué)方法獲得的結(jié)構(gòu)和鍵合信息 。本綜述旨在讓讀者更深入地了解 DSC 在基于 DNA 的治療中的應(yīng)用。雖然本綜述側(cè)重于基于 DNA 的復(fù)合物的量熱研究,但DSC差示掃描量熱儀在 RNA 中的應(yīng)用已在其他地方進(jìn)行了綜述 。
語(yǔ)言和術(shù)語(yǔ)的使用
在這篇綜述中,常用術(shù)語(yǔ)及其含義如下: (1) 配體(天然和合成)被松散地用于涵蓋任何分子(底物、抑制劑、藥物、輔因子、輔基、金屬離子、蛋白質(zhì)、核酸)。酸、探針、靶標(biāo)和修飾的核酸),它們與第二個(gè)分子非共價(jià)結(jié)合 [10,19]。DNA-配體相互作用也被松散地用于指代以下內(nèi)容:DNA-DNA、DNA-RNA、DNA-蛋白質(zhì)、DNA-脂質(zhì)、DNA-藥物和DNA-生物大分子結(jié)合反應(yīng)。(2) ΔG、ΔH、ΔS和ΔCр 分別表示通用吉布斯自由能變化、標(biāo)準(zhǔn)焓變、標(biāo)準(zhǔn)熵變和熱容變化。這些也稱為“熱力學(xué)曲線”。(3) 在標(biāo)準(zhǔn)條件下(反應(yīng)物和產(chǎn)物的濃度為 1.00 M,溫度為 25°C,1.00 個(gè)大氣壓,pH 值為 7.0),它們分別被指定為ΔG °、ΔH ° 和ΔS °。從 DSC 熔融實(shí)驗(yàn)中獲得的所報(bào)告的量熱熱力學(xué)值被指定為,
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